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| Registros recuperados: 140 | |
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| Angles D'Auriac, Marc B.; Rinde, Eli; Norling, Pia; Lapegue, Sylvie; Staalstrom, Andre; Hjermann, Dag O.; Thaulow, Jens. |
| The Pacific oyster, Crassostrea gigas, was introduced to Europe for aquaculture purposes, and has had a rapid and unforeseen northward expansion in northern Europe. The recent dramatic increase in number of C. gigas populations along the species' northern distribution limit has questioned the efficiency of Skagerrak as a dispersal barrier for transport and survival of larvae. We investigated the genetic connectivity and possible spreading patterns between Pacific oyster populations on the southern Norwegian coast (4 localities) and Swedish and Danish populations by means of DNA microsatellite analysis of adult oysters, and by simulating larvae drift. In the simulations we used a 3D oceanographic model to explore the influence of recent climate change... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00385/49589/50101.pdf |
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| Arzul, Isabelle; Baillon, Laury; Boudry, Pierre; Bouget, Jean-francois; Chollet, Bruno; Cochet, Helene; Couraleau, Yann; Dubreuil, Christine; Duchene, Julie; Dutartre, Julie; Garcia, Celine; Heloury, Purotu; Heurtebise, Serge; Huchet, Eve; Hussenot, Mathieu; Langlade, Aime; Ollier, Simon; Omnes, Emmanuelle; Pouvreau, Stephane; Roby, Charlotte; Serpin, Delphine; Viard, Frederique; Wacrenier, Candice; Lapegue, Sylvie. |
| L’huître plate (Ostrea edulis) est une espèce endémique des côtes européennes, elle est présente depuis des millions d’années. Son aire de répartition est très vaste allant de la Norvège jusqu’au Maroc. Elle est également présente en mer Méditerranée, en mer Noire, mais également au Canada, aux Etats-Unis ou encore en Afrique du Sud, à la suite d'introductions pour des raisons aquacoles. En France, à partir de la fin des années 70, de fortes mortalités ont été constatées sur les bancs naturels et en élevage, faisant rapidement chuter la production de 20 000 tonnes à 2 000 tonnes. Ces mortalités ont été attribuées à deux maladies parasitaires : la marteiliose (due au parasite Marteilia refringens) et la bonamiose (due au parasite Bonamia ostreae). Trente... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2014 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00247/35815/34328.pdf |
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| Arzul, Isabelle; Feist, Steve; Figueras, Antonio; Lapegue, Sylvie; Paillard, Christine; Furones, Dolors. |
| The European shellfish industry enjoys a privileged position on the global scene. Its social dimension is essential, as it employs a high number of people in more than 8000 companies, mostly micro-companies. Shellfish production in Europe is little diversified and mainly relies on the industrially produced mussels, oysters and clams. Over the recent years, this sector has grown more slowly than other fish farming sectors, notably because it depends a great deal on the environmental quality and the emergence of diseases. Mortality events, linked to pathogen organisms such as viruses, bacteria and parasites (protozoa), tend to weaken the production’s sustainability. In this context, the European project VIVALDI (PreVenting and mItigating farmed biVALve... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2016 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00352/46307/45975.pdf |
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| Batista, Frederico; Boudry, Pierre; Lapegue, Sylvie; Heurtebise, Serge; Monteiro, C. C.. |
| The Portuguese oyster, Crassostrea angulata, was introduced from Portugal to the French Atlantic Coast in the 1860s. C. angulata quickly settled and expanded and leaded to the development of a new aquacultural industry in France. In the late 1960s, mortality associated with the detection of an iridovirus, led to the wipe out of C. angulata from French Atlantic waters and to the massive introduction of C. gigas to sustain production. In Southern Europe, similar symptoms were also observed in natural stocks of C. angulata from Sado River (Portugal) and from the area of Cadiz (Spain). Nowadays, only very few «pure» populations of C. angulata remain in southern Europe. These populations are potentially endangered by the current expansion of C. gigas... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Selection; Hybridization; Settlement pattern; Population genetic; Genetic; Oysters; Crassostrea angulata; Crassostrea gigas. |
| Ano: 2005 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/acte-3310.pdf |
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| Batista, Frederico; Leitao, Alexandra; Huvet, Arnaud; Lapegue, Sylvie; Heurtebise, Serge; Boudry, Pierre. |
| The taxonomic status of the Portuguese oyster Crassostrea angulata and the Pacific oyster Crassostrea gigas has often been a matter of controversy. Based on larval shell morphology, experimental hybridisation and electrophoretic studies of enzyme polymorphism several authors have considered these two species as being synonymous. During the recent years, several genetic studies based on mitochondrial DNA and microsatellites data have provided evidences that the two taxa are genetically distinct although closely related. Furthermore, karyotype analyses have also highlighted the close genetic similarity of these taxa in comparison with other cupped oyster species. However, a comparative analysis of restriction enzymes ideograms revealed differences between... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Geographical origin; Phylogenetic; Genetic; Taxonomic status; Crassostrea angulata; Oyster. |
| Ano: 2005 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/acte-3433.pdf |
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| Bayne, B. L.; Ahrens, M.; Allen, S. K.; D'Auriac, M. Angles; Backeljau, T.; Beninger, P.; Bohn, R.; Boudry, Pierre; Davis, J.; Green, T.; Guo, X.; Hedgecock, D.; Ibarra, A.; Kingsley-smit, P.; Krause, M.; Langdon, C.; Lapegue, Sylvie; Li, C.; Manahan, D.; Mann, R.; Perez-paralle, L.; Powell, E. N.; Rawson, P. D.; Speiser, D.; Sanchez, J. -l.; Shumway, S.; Wang, H.. |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2017 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00418/52944/53886.pdf |
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| Bechemin, Christian; Soletchnik, Patrick; Polsenaere, Pierre; Le Moine, Olivier; Pernet, Fabrice; Protat, Martin; Fuhrmann, Marine; Quere, Claudie; Goulitquer, Sophie; Corporeau, Charlotte; Lapegue, Sylvie; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin; Garrigues, Manon; Garcia, Celine; Haffner, Philippe; Dubreuil, Christine; Faury, Nicole; Baillon, Laury; Baud, Jean-pierre; Renault, Tristan. |
| Mass mortality outbreaks (90-100%) in both juvenile and adult blue mussels were reported in 2014 along the Pertuis Charentais area of the French Atlantic coast. A series of studies were carried out to learn more about the phenomenon through detecting pathogens, describing environmental conditions and establishing the physiological status of the animals. Bacteria identif ied as belonging to the V. splendidus species were detected in dying mussels and seem able to cause mortality in blue mussels in the laboratory. Unusual environmental conditions (large amounts of fresh water, re-suspension of sediments during a series of storms, and a high renewal rate of specific water masses in Brittany’s Pertuis area) may be partially responsible for sparking the phenomen |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Mortalités; Moules; Pertuis Charentais; Vibrio splendidus; Environnement; Mortality; Mussels; Pertuis Charentais; Vibrio splendidus; Environment. |
| Ano: 2015 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00312/42343/41682.pdf |
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| Bechemin, Christian; Soletchnik, Patrick; Polsenaere, Pierre; Le Moine, Olivier; Pernet, Fabrice; Protat, Martin; Fuhrmann, Marine; Quere, Claudie; Goulitquer, Sophie; Corporeau, Charlotte; Renault, Tristan; Lapegue, Sylvie; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin; Garriques, Manon; Garcia, Celine; Haffner, Philippe; Dubreuil, Christine; Faury, Nicole; Baillon, Laury; Baud, Jean-pierre. |
| Suite aux surmortalités observées au sein des élevages de moules touchant à la fois les animaux adultes et les juvéniles au mois de mars, dans les Pertuis Charentais, la Direction Générale de l’Alimentation (DGAl) a adressé une saisine à Ifremer le 04 avril 2014. Celle-ci fait état d’une demande d’appui scientifique et technique d’Ifremer pour tenter d’apporter des éléments de réponse par rapport à cette mortalité subite et importante. L’Ifremer a proposé un projet d’action permettant l’expertise du phénomène de surmortalité de la moule bleue, selon 3 axes : l’impact environnemental, la pathologie et les caractéristiques physiologiques des moules. Il s’agit de mettre en évidence la présence ou non d’agents infectieux connus ou émergents, d’apporter des... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2014 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00229/34022/32387.pdf |
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| Bernard, Ismael; Lapegue, Sylvie; Dumas, Franck; Talarmain, Eric; Cornette, Florence; Degremont, Lionel; Chavanne, Herve; Pouvreau, Stephane; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; Plus, Martin; Le Moine, Olivier; Boudry, Pierre. |
| La forte augmentation des mortalités de juvéniles d’huître creuse depuis 2008 a relancé la problématique de l’approvisionnement en naissains de l’ostréiculture française. Dans ce contexte, cette étude a pour objectif d’étudier la faisabilité d’opérations de repeuplement en huîtres génétiquement plus résistantes, afin d’améliorer les performances de survie du naissain capté dans le milieu naturel. Cette étude s’est ainsi focalisée sur les deux bassins naisseurs historiques, Marennes-Oléron et Arcachon. Nous avons donc cherché à établir (1) une hiérarchie des bancs en fonction de l’expulsion de larves d’huître dans le bassin d’Arcachon, (2) une cartographie des liens en termes de connectivité entre les bancs des pertuis charentais et (3) la faisabilité du... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2012 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19410/17013.pdf |
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| Bierne, Nicolas; Boudry, Pierre; Lapegue, Sylvie; Bonhomme, Francois; Faure, M; Sauvage, Christopher; Moraga, D; Boutet, Isabelle; David, Elise; Jollivet, Didier; Tanguy, Arnaud; Faure, Baptiste; David, Patrice. |
| For a long time, population geneticists have had to content themselves with analysing neutral markers to infer selection processes indirectly. The recent improvement of sequencing tools now enables them to analyse the variations of a large number of genes and therefore to spot the genes, or the amino acids, which are under the direct influence of the selection (Yang & Bielawski, 2000). In order to analyse the selection processes acting on the mutations and discriminate the different factors acting on their evolution (genetic selection or drift), it is essential to compare polymorphism data between genomes of the same species/population and divergence data between species/populations (Kimura, 1983). Recently, polymorphism data has become available for a... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2006 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-6489.pdf |
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| Bigot, L.; Dubos, M. P.; Dheilly, N.; Favrel, P.; Kellner, K.; Lelong, C.; Martinez, A. S.; Riviere, G.; Santerre, C.; Sourdaine, P.; Degremont, Lionel; Flahauw, Emilie; Hatt, Philippe-jacques; Heurtebise, Serge; Lapegue, Sylvie; Azzouzi, N.; Galibert, F.; Boudry, Pierre; Corporeau, Charlotte; Fabioux, Caroline; Guevelou, Eric; Huvet, Arnaud; Sussarellu, Rossana. |
| Le projet GAMETOGENES vise à améliorer les connaissances des bases physiologiques et génétiques de la reproduction et des métabolismes associés chez un mollusque d'importance économique l'huître creuse, Crassostrea gigas. Il a pour objectifs (1) la définition de marqueurs clés de la gamétogenèse, de l'investissement reproducteur et du déterminisme du sexe chez une espèce hermaphrodite à protandrie irrégulière (2) la recherche de QTL de survie aux mortalités estivales ou à l'effort de reproduction dont le succès repose sur l'augmentation de la densité de marqueurs sur les cartes génétiques existantes (SNP en particulier) et sur les liens qui pourront être établis entre ces cartes de liaison et une carte physique (3) le développement d'outils pour valider la... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Génétique; Huître creuse; Crassostrea gigas; Gamétogenèse; QTL; Marqueur; Physiologie. |
| Ano: 2012 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21781/19355.pdf |
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| Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Lapegue, Sylvie; Lam, Katherine; Mccombie, Helen; Leitao, Alexandra; Gerard, Andre. |
| L'étude de la variabilité génétique de l'huître creuse Crassostrea gigas est un point essentiel dans la mise en place de programmes de gestion des ressources génétiques et de sélection chez cette espèce. C. gigas, originaire du Japon, a été introduite dans de nombreuses régions du monde et représente aujourd'hui plus de 95 'ro de la production mondiale d'huîtres. Introduite en France au début des années 1970 pour remplacer l'huître portugaise Crassostrea angulata, c'est aujourd'hui une ressource de première importance pour notre région. Malgré la maîtrise du cycle de reproduction de l'espèce et son importance commerciale, elle n'a pas été génétiquement améliorée et on peut donc considérer les stocks comme « sauvages» ou « non domestiqués ». De plus, la... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Génétique; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Crassostrea gasar; Variabilité génétique. |
| Ano: 2002 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31008/29411.pdf |
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| Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Lapegue, Sylvie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre. |
| Dans le cadre du plan Etat-Région 1994-1998, un programme de conservatoire de souches a été initié au Laboratoire IFREMER de La Tremblade. Ce conservatoire a pour objectif d'acclimater différentes espèces ou souches d'huîtres creuses (genres Crassostrea et Saccostrea) afin d'acquérir des connaissances sur ces espèces et d'évaluer l'intérêt qu'elles pourraient présenter pour l'ostréiculture locale. L'importation d'espèces étrangères sur les côtes françaises est désormais strictement réglementée: la dissémination d'une nouvelle espèce peut se révéler néfaste d'un point de vue écologique et nuire aux productions existantes. De plus, ces huîtres peuvent être porteuses de pathogènes qui, s'il venaient à se répandre dans le milieu, pourraient toucher les stocks... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Croisement; Crassostrea gigas; Crassostrea ariakensis; Crassostrea sikamea; Hybridation. |
| Ano: 1999 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15514/12901.pdf |
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| Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Fabioux, Caroline; Lapegue, Sylvie. |
| Crassostrea angulata and Crassostrea gigas, two cupped oyster taxa of Asian origin (O'Foighil et al, 1998), were successively introduced into Europe during the XVIth and the XXth century respectively (Héral and Grizel, 1991). To date, populations presumed to be C. angulata remain only in the south of Spain and Portugal, while the geographic range of C. gigas is expending, notably due to aquaculture. The two taxa can be distinguished by RFLP analysis of the mitochondrial Cytochrome Oxydase I locus (COI). This marker revealed strong genetic differentiation between Asian populations of the two taxa (Boudry et al., 1998). In contrast, nuclear markers showed a much lower genetic differentiation (Huvet et al, in press). The absence of any reproductive barrier... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Microsatellite; Genetic; Crassostrea angulata; Crassostrea gigas; Oysters. |
| Ano: 2001 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3453.pdf |
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| Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Fabioux, Caroline; Lapegue, Sylvie; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Blouin, Frederic; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre. |
| L'étude de la variabilité génétique de l' huître creuse Crassastrea gigas est un point essentiel dans la mise en place de programmes de gestion des ressources génétiques et de sélection chez cette espèce. C. gigas, originaire du Japon, a été introduite dans de nombreuses régions du monde et représente aujourd'hui plus de 95 % de la production mondiale d' huîtres. Introduite en France au début des années 1970 pour remplacer l' huître portugaise Crassostrea angulata, c'est aujourd 'hui une ressource de première importance pour notre région. Malgré la maîtrise du cycle de reproduction de l'espèce et son importance commerciale, elle n' a pas été génétiquement améliorée et on peut donc considérer les stocks comme « sauvages» ou « non domestiqués ». De plus, la... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Génétique; Ressources génétiques; Différenciation génétique; Hybridation; Anomalies chromosomiques; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Crassostrea angulata. |
| Ano: 2000 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15564/12955.pdf |
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| Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Lapegue, Sylvie; Sauvage, Christopher; Tanguy, A.; Moraga, D.; Goostrey, A.; Prunet, P.; Boulo, Viviane; Gueguen, Y.; Moal, Jeanne; Fleury, Elodie; Samain, Jean-francois; Mathieu, M.; Favrel, P.. |
| Rationale for EST and genome sequencing of the Pacific oyster: its membership of the Lophotrochozoa, an little studied branch of the Eukaryotes, its worldwide aquacultural importance (4.2 million metric tons, worth 3.5 billion US dollars), its high fecundity, with concomitantly high DNA polymorphism, its use as a biosensor of coastal pollution. In 2004, an international community of biologists, the Oyster Genome Consortium (OGC) led by D. Hedgecock (University of Southern California) and uniting 70 participants from 10 countries, first presented the Pacific oyster Crassostrea gigas as a genome-sequencing candidate to Joint Genome Institute (JGI, USA) (Hedgecock et al., 2005). Besides this project (that remains to be accepted), several EST... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Characteristics; Genome size; Genome; Crassostrea gigas; Oyster; Genetic. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/acte-3414.pdf |
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| Boudry, Pierre; Lapegue, Sylvie; Guyomard, R.. |
| The Working Group on the Application of Genetics in Fisheries and Mariculture (WGAGFM) met in La Rochelle, France from 10-12 March, 2003. Seven persons representing six countries were present. Three terms of reference (ToR) were addressed, while one was deferred until the appropriate information was available for review. WGAGFM first considered ToR a) Review and report on the practical use of genome mapping in aquacultured organisms. Genome maps are used extensively in the production of selected strains of agriculture plants and livestock. Studies on the genome of aquatic animais have been summarised in the WG report. Genome mapping projects in aquaculture exist for most major species and linkage maps are now becoming available. WGAGFM produced four... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Conservation of genetic diversity; Triploids; Recommandation; Aquaculture; Fish; Genome mapping; Genetic. |
| Ano: 2003 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3301.pdf |
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| Boudry, Pierre; Launey, Sophie; Diaz-almela, A.; Naciri-graven, Yamama; Ledu, Christophe; Mira, S.; Taris, Nicolas; Bonhomme, Francois; Lapegue, Sylvie. |
| PCR-based DNA markers enable the study of diversity and differentiation of marine organisms at different stages of their life cycle. Our study of European fiat oyster (Ostrea edulis) populations aimed to describe their spatial and temporal dynamics. First, we analyzed adults sampled over the natural range of the species. An Atlantic/Mediterranean differentiation pattern was observed. Similar patterns of variation were found using allozymes, microsatellites and mitochondrial DNA, aIl which support an isolation by distance model. High variability was observed in the range of diversity between populations using a mitochondrial marker, a reflection of small effective population sizes in sorne locations. A 10fold quantitative difference was observed in Fst,... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Recruitment; Diversity; Molecular markers; Population genetics; Ostrea edulis; Flat oyster; Dynamique de recrutement; Diversité génétique; Microsatellites; Marqueurs moléculaires; Génétique des populations; Ostrea edulis; Huître plate. |
| Ano: 2003 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-2851.pdf |
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| Registros recuperados: 140 | |
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